30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1933 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1933  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  702    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.235318  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  25.16 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  26.73 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25.82 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  24.4 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  23.03 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  27.5 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  24.61 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  25.92 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  24.31 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  23.38 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  22.67 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  25.36 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  23.4 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  24.92 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  22.67 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  23.79 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  26.5 
 
 		 330 aa  49.7  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.71 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  23.08 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  26.53 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  26.53 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  27.99 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  22.22 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  20.06 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  25.75 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  22.22 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  23.53 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  29.18 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  20.62 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>