35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1222 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  52.85 
 
 
332 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  55.25 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  55.56 
 
 
333 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  48.45 
 
 
330 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  49.68 
 
 
330 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  49.84 
 
 
330 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  49.84 
 
 
330 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  59.26 
 
 
330 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  39.14 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  24.24 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  24.73 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  29.18 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  22.9 
 
 
340 aa  57.4  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  27.59 
 
 
309 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  26.72 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  21.45 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  24.09 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  22.41 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  30.34 
 
 
323 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  23.42 
 
 
352 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  27.16 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  25.42 
 
 
338 aa  46.2  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  24.92 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  27.33 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  28.47 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  26.35 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  19.27 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  21.53 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  22.56 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  23.23 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  33.03 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  26.28 
 
 
342 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  32.19 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  28.85 
 
 
392 aa  43.1  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>