41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17930 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  621  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  61.75 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  62.05 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  57.55 
 
 		 332 aa  345  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  57.23 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  57.23 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  57.84 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  57.84 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  57.14 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  38.91 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  24.83 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  27.08 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  25 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.35 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  24 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  22.7 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  24.56 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  31.11 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0043  hypothetical protein  26.02 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  29.09 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  21.24 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  21.83 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  22.11 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  23.6 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  23.15 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  23.34 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  24.63 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  39.6 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  20.38 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  23.75 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  23.93 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  21.7 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  21.32 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  22.92 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  23.02 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  31.72 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  25.09 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  32.19 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2758  hypothetical protein  29.86 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  27.18 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  27.94 
 
 		 332 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>