45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3465 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  696    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  48.12 
 
 		 346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  41.06 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  34.33 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  37.38 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  28.53 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  31.45 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  27.61 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  30.43 
 
 		 356 aa  99.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  28.14 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  27.13 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  26.9 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  27.59 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  26.79 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  26.63 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  26.76 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  32.84 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  27.34 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  25.25 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  26.09 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  26.62 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  28.7 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  28.08 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  23.95 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  25.22 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  24.32 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  25.81 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  22.35 
 
 		 586 aa  53.1  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  23.3 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  24.28 
 
 		 574 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  29.63 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  28.26 
 
 		 341 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.07 
 
 		 775 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  25.07 
 
 		 613 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  27.27 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  24.09 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  23.87 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  27.69 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  26.71 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  22.45 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  23.3 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  23.91 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  27.38 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>