46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1578 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  685    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  30.86 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  31.94 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  28.95 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  29.91 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  27.56 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  29.18 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  28.35 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  28.92 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  23.65 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  27.65 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  30.42 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  29.37 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  40.34 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  29.21 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  38.1 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  27.6 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  37.84 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  30.62 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  34.18 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  24.72 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  26.9 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.57 
 
 		 775 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  28.81 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  34.4 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  30.32 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  28.4 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  23.91 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  23.51 
 
 		 574 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  25.71 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  24.93 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  30.28 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  32.46 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  33.44 
 
 		 363 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  26.21 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  33.44 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  23.51 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  20.99 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  33.8 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  23.69 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  23.32 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  26.6 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  20.94 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.92 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>