29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3687 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  33.43 
 
 		 317 aa  200  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  35.14 
 
 		 342 aa  195  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  34.75 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  30.23 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  34.23 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  30.22 
 
 		 347 aa  132  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  32.72 
 
 		 349 aa  129  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  33.09 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  28.43 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  31.73 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  27.81 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  23.08 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  34.55 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  30.36 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  27.1 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  25.94 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  35.42 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  27.68 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  25.17 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  23.44 
 
 		 339 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  24.63 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  36.49 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  26.77 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  30.08 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  26.06 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  24.48 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  25.63 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>