66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2685 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  64.6 
 
 
340 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  65.49 
 
 
340 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  58.33 
 
 
336 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  52.31 
 
 
339 aa  345  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  56.63 
 
 
336 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  55.84 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  32.74 
 
 
360 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  31.13 
 
 
350 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  30.89 
 
 
328 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  30.84 
 
 
360 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  29.07 
 
 
346 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  31.5 
 
 
363 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  30.43 
 
 
363 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  30.43 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  29.77 
 
 
334 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  27.74 
 
 
341 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  28.98 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  25.1 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  26.98 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  24.52 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  24.45 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  24.92 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  24.04 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.07 
 
 
775 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  25.79 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25.07 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  23.51 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  25.44 
 
 
574 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
606 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  25.75 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4038  hypothetical protein  23.73 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  30.51 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  22.65 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  25.17 
 
 
326 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  24.1 
 
 
370 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  25.94 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  20.67 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  25.32 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  23.29 
 
 
378 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  24.2 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  23.49 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  26.27 
 
 
340 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  31.13 
 
 
298 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  23.53 
 
 
346 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  37.14 
 
 
356 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 
586 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  26.9 
 
 
326 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  30 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  30.77 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  25.48 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  29.03 
 
 
289 aa  50.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
613 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  21.23 
 
 
318 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  27.82 
 
 
297 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  30.83 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  23.9 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  21.02 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  29.01 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  23.08 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  30.83 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  24.83 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  28.79 
 
 
320 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0513  hypothetical protein  27.34 
 
 
224 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  24.05 
 
 
281 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>