49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0521 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  639    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  53.52 
 
 
326 aa  349  4e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  54.09 
 
 
319 aa  317  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  52.78 
 
 
326 aa  312  4.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  43.07 
 
 
333 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  32.51 
 
 
574 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  33.23 
 
 
606 aa  135  9e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  31.77 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  24.67 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  41 
 
 
613 aa  75.9  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  24.37 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
586 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25.48 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  22.9 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  25.82 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  23.25 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  24.81 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  25.1 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  25.76 
 
 
378 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  23.21 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  27.75 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  24.88 
 
 
351 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  24.44 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  24.36 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  25.33 
 
 
370 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  28.84 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  24.35 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  28.45 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1100  hypothetical protein  26.88 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  30 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  21.83 
 
 
347 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  23.94 
 
 
342 aa  49.7  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  27.78 
 
 
333 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0915  hypothetical membrane spanning protein  26.2 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  26.72 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  24.21 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  22.81 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  20.45 
 
 
304 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  45.95 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  26.84 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  32.74 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  24.81 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  21.28 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  23.3 
 
 
350 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  25.77 
 
 
336 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  29.35 
 
 
331 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  20.82 
 
 
318 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0729  hypothetical protein  35.9 
 
 
295 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  27.54 
 
 
349 aa  42.4  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>