76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2516 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  56.63 
 
 
342 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  56.19 
 
 
339 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  55.76 
 
 
340 aa  345  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  54.85 
 
 
340 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  51.39 
 
 
336 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  52.68 
 
 
329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  27.66 
 
 
360 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  28.93 
 
 
346 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  30.09 
 
 
350 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  34.54 
 
 
363 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  28.36 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  31.68 
 
 
360 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  33.33 
 
 
363 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  33.33 
 
 
363 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  29.49 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  25.26 
 
 
339 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  25.71 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  27.08 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  27.89 
 
 
378 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  27.08 
 
 
574 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  26.78 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  25.17 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  28.79 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  25.24 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.41 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  25.46 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  25.25 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  22.22 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  28.26 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4038  hypothetical protein  35.06 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  25.71 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  24.84 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  24.61 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  25.16 
 
 
349 aa  63.5  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  29.11 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.3 
 
 
775 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  23.9 
 
 
378 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  27.61 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  26.86 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  22.18 
 
 
318 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  22.18 
 
 
318 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
586 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  22.98 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  25.89 
 
 
391 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 
606 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  32.38 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  22.83 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
613 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  25.57 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  23.05 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  21.81 
 
 
321 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  22.78 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  23.34 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  24.05 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  21.86 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  22.08 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  27.68 
 
 
330 aa  49.3  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  22.1 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  26.67 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  25.95 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  29.45 
 
 
322 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  46.2  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  30.23 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  35.44 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  25.71 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  31.87 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  24.39 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1100  hypothetical protein  31.09 
 
 
287 aa  43.5  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0915  hypothetical membrane spanning protein  31.09 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  22.94 
 
 
326 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  24.12 
 
 
346 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  21.47 
 
 
326 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>