34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4413 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  633  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  26.56 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  25.63 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  24.43 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  24.44 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  24.44 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  25.17 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  23.95 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  25.5 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  25.61 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  28.06 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  22.44 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  23.1 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 		 586 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  25.29 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  23.08 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  20.31 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  21.75 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  21.24 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  24.78 
 
 		 319 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  25.4 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  23.53 
 
 		 380 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  19.93 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  30.59 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  23.65 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  23.73 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  22.76 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  22.65 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  22.64 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  17.25 
 
 		 360 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  21.55 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  23.81 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  21.54 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  21.4 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>