22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1410 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  690    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  83.29 
 
 		 347 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  24.69 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  23.68 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  27.4 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  24.19 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  25.64 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  23.08 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  20.2 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  23.57 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  24.12 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  25.8 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  24.65 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  31.33 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  35.9 
 
 		 319 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  27.01 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  31.52 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  32.97 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  24.74 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  23.81 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  30.49 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>