19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0549 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  692    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  83.29 
 
 		 347 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  25.29 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  25.44 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  26.69 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  25.96 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  21.54 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  23.97 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  27.36 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  24.39 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  34.15 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  31.33 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  34.38 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  32.5 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  40.98 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  23.64 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  32.04 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>