29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2879 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  632  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  32.45 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  31.23 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  32.91 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  30.98 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  31.54 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  30.43 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  31.48 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  27.15 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  30.08 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  29.57 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  29.57 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  30.69 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  25.29 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  30.71 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  29.59 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  30.3 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  26.77 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  44.83 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  23.08 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  25.25 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  26.4 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1527  hypothetical protein  30.34 
 
 		 188 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  30.77 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  24.81 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  32.99 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  17.63 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  25.58 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  38.71 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>