56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1082 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  586  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  23.69 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  22.73 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  23.83 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  22.73 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0725  hypothetical protein  26.42 
 
 
242 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  23.44 
 
 
574 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  24.72 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  23.28 
 
 
378 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  22.95 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  23.66 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  23.93 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  25.78 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  22.97 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  22.79 
 
 
326 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  29.89 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  23.03 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  31.3 
 
 
336 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  21.09 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  23.88 
 
 
326 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  20.52 
 
 
340 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  24.3 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  26.09 
 
 
319 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  20.2 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  23.86 
 
 
386 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  22.86 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  25.3 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  20.63 
 
 
586 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  26.21 
 
 
347 aa  50.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  20.66 
 
 
333 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  25.83 
 
 
346 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.79 
 
 
775 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  21.83 
 
 
334 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  25.22 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  27.23 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  27.27 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  19.87 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  24.18 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  22.06 
 
 
328 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  20.45 
 
 
325 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  22.45 
 
 
359 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  25.17 
 
 
325 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  23.67 
 
 
350 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  24.91 
 
 
331 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  28.78 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  26.12 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  24.8 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  24.74 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  25.89 
 
 
339 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  23.2 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  28.46 
 
 
336 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  22.09 
 
 
342 aa  42.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2184  hypothetical protein  23.08 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  23.36 
 
 
335 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  25.21 
 
 
385 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  23.92 
 
 
314 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>