49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0160 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  729    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  41.19 
 
 
613 aa  215  9e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  43.01 
 
 
606 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  31.99 
 
 
574 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  33.78 
 
 
333 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  35.47 
 
 
326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  33.44 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  30.7 
 
 
319 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  30.48 
 
 
326 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  28.57 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  27.02 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
586 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  28.07 
 
 
328 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  29.28 
 
 
341 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  25.41 
 
 
342 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  30.58 
 
 
336 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  25.15 
 
 
378 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  25.17 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  27.45 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  25.16 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  29.45 
 
 
329 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  29.04 
 
 
345 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  20.7 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  26.32 
 
 
316 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  20.99 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  25.87 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  28.16 
 
 
345 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  20.23 
 
 
340 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  32.28 
 
 
351 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  21.43 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  27.36 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2416  hypothetical protein  38.17 
 
 
335 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0787706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1542  hypothetical protein  37.8 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  24.17 
 
 
360 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1447  hypothetical protein  37.8 
 
 
329 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.485556  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  25.32 
 
 
304 aa  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  29.43 
 
 
346 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  25.93 
 
 
347 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  27.14 
 
 
335 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  25.55 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  31.3 
 
 
340 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  23.81 
 
 
340 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  28.33 
 
 
339 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  26.05 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  20.83 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  21.58 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  29.93 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  23.51 
 
 
342 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  27.18 
 
 
341 aa  43.1  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>