35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1542 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1542  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1447  hypothetical protein  98.48 
 
 
329 aa  571  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.485556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2416  hypothetical protein  92.24 
 
 
335 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0787706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  56.47 
 
 
346 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  27.18 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.69 
 
 
775 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  24.84 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  22.94 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  25.48 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  24.92 
 
 
340 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  23.91 
 
 
341 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  27.07 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  23.82 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  23.87 
 
 
350 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  28 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  32.28 
 
 
391 aa  59.7  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  21.26 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  24.83 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  26.58 
 
 
340 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  30.18 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  23.71 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  27.09 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  19.56 
 
 
316 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  25.45 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  27.04 
 
 
326 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
586 aa  49.7  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  24.46 
 
 
330 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  25.42 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25.77 
 
 
321 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  21.98 
 
 
319 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  26.1 
 
 
304 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  21.82 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  26.51 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  31.03 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  34.25 
 
 
396 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>