76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1364 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  532  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  49.6 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  48.24 
 
 		 256 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.21 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  47.62 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  38.74 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  37.45 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  37.2 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  29.63 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  31.8 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  30.96 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  30.8 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  31.38 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  32.33 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  26.54 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.88 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  30.13 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  35.36 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  31 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.85 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  29.05 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  28.93 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 237 aa  85.5  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  28.75 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.51 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  32.47 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.51 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  28.51 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.1 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  33.16 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  32.52 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  29.23 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  32.16 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  27.19 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  26.77 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.84 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  26.86 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  28.7 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  27.71 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.83 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.58 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.48 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  27.43 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  29.41 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.21 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.8 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  30.52 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  27.32 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.11 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  24.46 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  24.55 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.12 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  23.41 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  22.73 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  27.78 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.58 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0983  hypothetical protein  35.29 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00469912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  25.76 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  25.48 
 
 		 283 aa  52  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.53 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  26.6 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  25.57 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  26.91 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  21.82 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  26.54 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  27.31 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.38 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  24.57 
 
 		 301 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  28.23 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7092  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.32 
 
 		 631 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3403  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.32 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  25.81 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5952  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.52 
 
 		 631 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0955687  decreased coverage  0.00791612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  24.31 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  26.2 
 
 		 287 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>