113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0725 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  837    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  63.05 
 
 		 412 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  58.78 
 
 		 409 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  54.68 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  51.53 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  41.96 
 
 		 437 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  35.32 
 
 		 437 aa  233  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  33.98 
 
 		 437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  28.77 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  30.77 
 
 		 436 aa  176  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  31.97 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  32.42 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  30.93 
 
 		 439 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  30.43 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  29.37 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  29.95 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  27.78 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  30.81 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  28.67 
 
 		 423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  29.67 
 
 		 436 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  27.59 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  28.17 
 
 		 450 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  27.51 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  28.91 
 
 		 428 aa  117  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  27.27 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  29.71 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  28.37 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  28.6 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  28.6 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  28.6 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3309  amine oxidase  26.08 
 
 		 484 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.76 
 
 		 722 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  27.86 
 
 		 624 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  24.74 
 
 		 589 aa  60.1  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.99 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  29.11 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  24.8 
 
 		 479 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  28.33 
 
 		 488 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  25.83 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  25.08 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.46 
 
 		 424 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.12 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  25.99 
 
 		 421 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  26.02 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  37.18 
 
 		 599 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.59 
 
 		 472 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.8 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  24.66 
 
 		 475 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.08 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  26.18 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  24.44 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.2 
 
 		 459 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  22.53 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  22.53 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  22.5 
 
 		 480 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  24.38 
 
 		 475 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  22.46 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  24.58 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  25 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  24.9 
 
 		 552 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.38 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  21.95 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  24.9 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  20.58 
 
 		 466 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  21.88 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  38.98 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  22.45 
 
 		 484 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  22.03 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  26.92 
 
 		 476 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  20.94 
 
 		 466 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.88 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  28.74 
 
 		 492 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.18 
 
 		 477 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  26.05 
 
 		 400 aa  46.6  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  29.11 
 
 		 396 aa  46.6  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  27.65 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  23.11 
 
 		 486 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  21.18 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  24.62 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  37.97 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  22.08 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  20.58 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  35.9 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  20.58 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  22.27 
 
 		 499 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  24.85 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  22.12 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  24.83 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  24.39 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  34.18 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  42.37 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  23.87 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  30.38 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  22.73 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  38.98 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0367  amine oxidase  25.59 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  51.11 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  24.15 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  32.18 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  38.03 
 
 		 479 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>