More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2307 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  100 
 
 		 451 aa  890    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  49.55 
 
 		 496 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  48.89 
 
 		 467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  36.05 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  34.31 
 
 		 448 aa  286  4e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  33.79 
 
 		 448 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  34.62 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  34.69 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  34.02 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  34.86 
 
 		 450 aa  263  6e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  32.89 
 
 		 446 aa  262  8e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  33.64 
 
 		 452 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  33.26 
 
 		 449 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  34.21 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  34.05 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  33.97 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  34.13 
 
 		 448 aa  256  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  34.53 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  34.21 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  34.21 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  33.49 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 456 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  34.21 
 
 		 449 aa  253  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  31.82 
 
 		 455 aa  251  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  34.21 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  34.21 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  34.32 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  31.67 
 
 		 443 aa  239  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  34.52 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 455 aa  236  9e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 455 aa  236  9e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  32.13 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  31.91 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  32.35 
 
 		 447 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 452 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  31.21 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  33.25 
 
 		 442 aa  230  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  29.35 
 
 		 465 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  32.2 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  31.15 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  31.15 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  31.15 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  31.15 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  31.15 
 
 		 451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  31.52 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  31.24 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  31.53 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  32.46 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  33.71 
 
 		 447 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 445 aa  219  8.999999999999998e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  30.82 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 477 aa  215  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  31.18 
 
 		 455 aa  216  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 459 aa  213  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 460 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 456 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  30.51 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 466 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  31.15 
 
 		 496 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  30.09 
 
 		 464 aa  206  9e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  30.66 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 466 aa  196  8.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  29.26 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  31.37 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.02 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 461 aa  179  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.01 
 
 		 447 aa  177  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 445 aa  176  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  32.28 
 
 		 451 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  27.58 
 
 		 472 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 460 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  30.29 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.7 
 
 		 472 aa  163  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.87 
 
 		 467 aa  163  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.07 
 
 		 446 aa  162  9e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.9 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 467 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.25 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1225  multi anti extrusion protein MatE  27.52 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.874219  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.7 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 451 aa  148  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  26.81 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>