More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1923 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  100 
 
 		 658 aa  1321    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  62.11 
 
 		 655 aa  853    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  66.41 
 
 		 642 aa  882    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  65.25 
 
 		 631 aa  848    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  53.94 
 
 		 671 aa  714    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  44.73 
 
 		 602 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  43.93 
 
 		 640 aa  555  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  41.59 
 
 		 618 aa  519  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  42.36 
 
 		 633 aa  513  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  42.37 
 
 		 625 aa  510  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  42.11 
 
 		 629 aa  497  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  41.68 
 
 		 631 aa  496  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  39.32 
 
 		 633 aa  473  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  37.22 
 
 		 651 aa  429  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  38.14 
 
 		 630 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  37.95 
 
 		 634 aa  426  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  37.36 
 
 		 630 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  37.21 
 
 		 630 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  36.42 
 
 		 597 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  34.15 
 
 		 605 aa  387  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  37.67 
 
 		 530 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  36.2 
 
 		 506 aa  301  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  34.74 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  35.76 
 
 		 517 aa  288  2e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  33.26 
 
 		 518 aa  269  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  34.67 
 
 		 521 aa  266  7e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  33.4 
 
 		 520 aa  264  4e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  33.48 
 
 		 519 aa  263  8.999999999999999e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  30.46 
 
 		 692 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  28.65 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  32.33 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.38 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  25.12 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  24.65 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  31.76 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  26.46 
 
 		 513 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  31.76 
 
 		 327 aa  60.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  26.56 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  26.56 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  26.56 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  31.08 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.59 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  24.87 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  27.72 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.89 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  28.14 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  30.61 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  31.45 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  27.54 
 
 		 452 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  28.67 
 
 		 671 aa  57  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  27.59 
 
 		 480 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  33.88 
 
 		 444 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  27.6 
 
 		 485 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 322 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  34.68 
 
 		 408 aa  56.2  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0722  type II secretion system protein E  32.03 
 
 		 385 aa  56.2  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  30 
 
 		 476 aa  56.2  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  32.58 
 
 		 468 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  25.5 
 
 		 423 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.59 
 
 		 322 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 444 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  29.59 
 
 		 322 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 478 aa  55.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  26.94 
 
 		 482 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  28.66 
 
 		 469 aa  55.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  27.46 
 
 		 482 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  27.23 
 
 		 521 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  27.15 
 
 		 449 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  25.98 
 
 		 991 aa  55.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  25.55 
 
 		 333 aa  55.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  29.13 
 
 		 612 aa  55.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  27.23 
 
 		 523 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  24.06 
 
 		 458 aa  55.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  30.88 
 
 		 473 aa  55.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  27.23 
 
 		 520 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  27.23 
 
 		 520 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  27.23 
 
 		 520 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  27.62 
 
 		 523 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  27.23 
 
 		 515 aa  54.7  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  30.83 
 
 		 504 aa  54.7  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  30.83 
 
 		 482 aa  55.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  31.34 
 
 		 492 aa  55.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  26.84 
 
 		 483 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  28.33 
 
 		 482 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.99 
 
 		 322 aa  54.3  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  30.41 
 
 		 321 aa  54.3  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  27.69 
 
 		 467 aa  54.3  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  25.52 
 
 		 490 aa  54.3  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  32.79 
 
 		 445 aa  54.3  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  25 
 
 		 484 aa  54.3  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  26.78 
 
 		 462 aa  53.9  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  31.2 
 
 		 560 aa  53.9  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  32.21 
 
 		 343 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  27.6 
 
 		 521 aa  53.9  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  30.41 
 
 		 342 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  30.65 
 
 		 451 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  25 
 
 		 467 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  27.52 
 
 		 498 aa  53.9  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.08 
 
 		 328 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 485 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>