More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2545 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  100 
 
 		 308 aa  596  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  40.86 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3614  integral membrane protein  43.77 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  38.28 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.42 
 
 		 287 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.27 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.23 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.14 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  25 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.21 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  24.77 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  26.94 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  28.05 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.59 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  28.79 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  32 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  28.14 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  26.27 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  27.96 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.77 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  27.62 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  26.49 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  26.75 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.11 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.27 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  30.77 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  23.2 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.25 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  29.62 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27.39 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  28.45 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.1 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  19.1 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  21.63 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.27 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  23.14 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.59 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.87 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  27.34 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.63 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  27.4 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  24.58 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  21.63 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.27 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  21.63 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  22.43 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  26.19 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  25.99 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  23.23 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.65 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  25 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  24.09 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  27.78 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  25.09 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  26.25 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  24.77 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  23.79 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  22.81 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  25.33 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.3 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.82 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  24.92 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  24.92 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  25.44 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  22.86 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  22.3 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  22.3 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  26.46 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  26.55 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  26.84 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.84 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  26.79 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  25.17 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  25.68 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  25.75 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  25.68 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>