More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0047 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0047  5-3 exonuclease family protein  100 
 
 		 304 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl055  5'-3' exonuclease  53.87 
 
 		 317 aa  342  7e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  37.06 
 
 		 895 aa  190  2e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  36.4 
 
 		 911 aa  185  8e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 888 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  32.89 
 
 		 883 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 875 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  32.67 
 
 		 878 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  30.27 
 
 		 891 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  31.12 
 
 		 888 aa  153  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  32.53 
 
 		 872 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  31.18 
 
 		 878 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  32.4 
 
 		 876 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  30.08 
 
 		 877 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  30.86 
 
 		 877 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  30.27 
 
 		 891 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  27.12 
 
 		 885 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  30.47 
 
 		 877 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  30.47 
 
 		 877 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  29.89 
 
 		 891 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  30.47 
 
 		 877 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  29.89 
 
 		 891 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  30.47 
 
 		 877 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  30.47 
 
 		 877 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  32.43 
 
 		 843 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  31.18 
 
 		 846 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  30.77 
 
 		 896 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  30.64 
 
 		 930 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  28.82 
 
 		 903 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  28.82 
 
 		 903 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  32.79 
 
 		 892 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  32.09 
 
 		 944 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  28.25 
 
 		 904 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 896 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  28.85 
 
 		 895 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  28.72 
 
 		 903 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf613  5'-3' exonuclease, exo domain of DNA polymerase I  32.95 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  28.35 
 
 		 908 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  33.22 
 
 		 936 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  31.33 
 
 		 924 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  28.85 
 
 		 868 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  31 
 
 		 953 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  32.16 
 
 		 870 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  30.77 
 
 		 885 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  32.08 
 
 		 879 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  32.68 
 
 		 866 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  35.62 
 
 		 888 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  27.41 
 
 		 1025 aa  138  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  29.64 
 
 		 917 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  32.68 
 
 		 866 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  30.71 
 
 		 891 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 968 aa  137  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  32.15 
 
 		 966 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  36.17 
 
 		 894 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  28.12 
 
 		 877 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  34.65 
 
 		 876 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  31.67 
 
 		 866 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  34.65 
 
 		 876 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  27.76 
 
 		 982 aa  136  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  30.69 
 
 		 924 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 909 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  30.48 
 
 		 977 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  33.6 
 
 		 850 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  29.06 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  31.56 
 
 		 928 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  32.63 
 
 		 879 aa  135  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  27.52 
 
 		 1020 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  32 
 
 		 861 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  30.16 
 
 		 873 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  34.7 
 
 		 893 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  27.9 
 
 		 886 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  29.46 
 
 		 929 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  27.09 
 
 		 893 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  29.46 
 
 		 920 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  29.46 
 
 		 910 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  29.46 
 
 		 920 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  26.64 
 
 		 901 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  33.07 
 
 		 932 aa  133  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  27.52 
 
 		 1032 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  29.87 
 
 		 972 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  31.21 
 
 		 946 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  28.29 
 
 		 949 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  29.15 
 
 		 1033 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  32.88 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  29.32 
 
 		 1013 aa  132  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  27.86 
 
 		 905 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  28.76 
 
 		 1043 aa  132  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  27.8 
 
 		 888 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  35.09 
 
 		 876 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  28.57 
 
 		 1025 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  31.89 
 
 		 937 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  27.13 
 
 		 955 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  31.89 
 
 		 937 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0036  5'-3' exonuclease  32.01 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.974407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  32.46 
 
 		 892 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  33.19 
 
 		 1045 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  30 
 
 		 474 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  32.16 
 
 		 979 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  29.64 
 
 		 878 aa  129  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  30.12 
 
 		 897 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>