More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1364 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  100 
 
 		 420 aa  849    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  61.19 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.77 
 
 		 514 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  47.48 
 
 		 1363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  43.53 
 
 		 532 aa  195  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.84 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.5 
 
 		 399 aa  182  9.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  66.34 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  51.68 
 
 		 184 aa  140  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  54.62 
 
 		 212 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  50.88 
 
 		 395 aa  99.8  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41.45 
 
 		 293 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  48.21 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.55 
 
 		 388 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  44.86 
 
 		 487 aa  87  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1025 aa  87  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  42.04 
 
 		 197 aa  85.5  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1002 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  48.89 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  41.38 
 
 		 1048 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46.46 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  49 
 
 		 175 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.98 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  45.45 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  46.39 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 535 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  37.96 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.28 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.45 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 177 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  49.45 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 177 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  41.41 
 
 		 133 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  47.75 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1009 aa  70.9  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.63 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  48.31 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  37.5 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  40.2 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  40.2 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  33.97 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.33 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  41.07 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.92 
 
 		 235 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  41.07 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  44.33 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  43.43 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  41.07 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  41.07 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  46.08 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  41.07 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  41.07 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  41.07 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  43.21 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  42 
 
 		 181 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.45 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  43.43 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.84 
 
 		 176 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1510  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  35 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  35 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  35.45 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  40.21 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  39.69 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  41.07 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  35.51 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.65 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  41.05 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  24.92 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  39.05 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  39.05 
 
 		 177 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  43.37 
 
 		 188 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.32 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  41 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  40.82 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  40.95 
 
 		 267 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  41.18 
 
 		 181 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>