More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1510 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1510  NLP/P60 protein  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1665  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  40.24 
 
 		 248 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  46.54 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  41.21 
 
 		 258 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  40 
 
 		 363 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  40 
 
 		 363 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  40 
 
 		 363 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  42.41 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  39.43 
 
 		 364 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  46.72 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  38.73 
 
 		 353 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  48.36 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  38.73 
 
 		 354 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  41.57 
 
 		 407 aa  118  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  40.96 
 
 		 407 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  40.96 
 
 		 407 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  40.96 
 
 		 407 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  40.96 
 
 		 407 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  50.45 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  40.96 
 
 		 407 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  40.7 
 
 		 404 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  40.96 
 
 		 404 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  40.96 
 
 		 404 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  42.18 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  42.18 
 
 		 177 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  45.08 
 
 		 226 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  38.73 
 
 		 369 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 418 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  36.75 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 382 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  41.5 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  39.46 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  39.51 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  39.16 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  36.14 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  43.9 
 
 		 197 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  41.23 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  43.57 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  38.36 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  43.09 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  42.28 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 224 aa  101  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 220 aa  101  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  39.64 
 
 		 223 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  39.64 
 
 		 223 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  38.74 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  34.87 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  39.64 
 
 		 221 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  40.54 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0020  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 208 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  38.74 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  38.74 
 
 		 234 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  38.74 
 
 		 234 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  38.74 
 
 		 223 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  38.74 
 
 		 234 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  38.74 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0829  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 165 aa  98.2  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.846153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  38.74 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  38.74 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  38.74 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 208 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  38.35 
 
 		 133 aa  97.8  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 192 aa  98.2  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 208 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 192 aa  97.4  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  37.29 
 
 		 226 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  36.64 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  46.6 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  37.29 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  40.68 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 269 aa  95.9  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  34.27 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 176 aa  95.5  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 278 aa  94.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  38.51 
 
 		 167 aa  94.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 234 aa  94.7  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  31.03 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  31.03 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  34.4 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  33.88 
 
 		 275 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  31.03 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  31.03 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  37.5 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  31.03 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  33.88 
 
 		 271 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>