More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3067 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  44.98 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  44.4 
 
 		 234 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  43.53 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  43.04 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  42.11 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  42.13 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  31.71 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  31.71 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  32.22 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  31.71 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  31.56 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  31.56 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  31.56 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  31.56 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  31.71 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  31.56 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  31.56 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  31.56 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  31.56 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  31.56 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  34.2 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.59 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  30.8 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.75 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  29.66 
 
 		 241 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  30.24 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.51 
 
 		 233 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  31.1 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.34 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  35.81 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  32.33 
 
 		 233 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.14 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 379 aa  96.3  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  29.11 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 235 aa  95.1  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  32.75 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  32.24 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  30.63 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  32.42 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  34.15 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  34.39 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  34.39 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 231 aa  92  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  31.06 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  31.51 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  32.34 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.76 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  30.68 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  29.33 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  34.63 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  30.68 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  30.53 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  27.35 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  31.47 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  34.89 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.75 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.7 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 288 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  33.48 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 238 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  31.53 
 
 		 230 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 226 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 		 235 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  31.3 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  29.06 
 
 		 225 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  31.14 
 
 		 234 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  30.36 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  30.17 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  34.2 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4324  GntR domain-containing protein  27.75 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  32.61 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  32.64 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  32.61 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>