76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0364 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  100 
 
 
265 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  31.62 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.79 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.12 
 
 
795 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.5 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  40.38 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  30.3 
 
 
280 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  26.13 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.05 
 
 
322 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  29.95 
 
 
335 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  26.48 
 
 
317 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  27.34 
 
 
316 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  27.93 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.77 
 
 
344 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  28.87 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  26.88 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  28.21 
 
 
461 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  37.97 
 
 
1002 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  34.94 
 
 
471 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  30.65 
 
 
361 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  30.3 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.25 
 
 
353 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.79 
 
 
659 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  29.27 
 
 
405 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  25.88 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  32.22 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.71 
 
 
326 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  33.1 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  24.87 
 
 
392 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  23.79 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  29.68 
 
 
396 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.94 
 
 
323 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  24.62 
 
 
447 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.27 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  28 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  26.56 
 
 
486 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  28.74 
 
 
363 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  24.17 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.33 
 
 
451 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  25.66 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  23.95 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.19 
 
 
287 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  29.03 
 
 
387 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  30.65 
 
 
219 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  23.7 
 
 
417 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  25.81 
 
 
372 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  23.7 
 
 
417 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  29.68 
 
 
422 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 
340 aa  45.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  31.62 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  31.18 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  31.87 
 
 
563 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  26.8 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  27.21 
 
 
419 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  26.61 
 
 
576 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  27.31 
 
 
406 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  22.98 
 
 
363 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.3 
 
 
462 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  36.49 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  27.6 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  25 
 
 
436 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  27.95 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  29.95 
 
 
414 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  25.27 
 
 
367 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  37.76 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  20.48 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
412 aa  43.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0122  S-formylglutathione hydrolase  25.56 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0127  esterase, putative  25.19 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  32.69 
 
 
224 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  31.17 
 
 
245 aa  42  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  35.71 
 
 
222 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  29.05 
 
 
229 aa  42  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  30.77 
 
 
222 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>