More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3223 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
654 aa  1306    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  41.67 
 
 
294 aa  209  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
655 aa  192  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
663 aa  190  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
477 aa  181  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  61.29 
 
 
644 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  52.45 
 
 
680 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
587 aa  162  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
734 aa  159  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
469 aa  158  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0922  hypothetical protein  31.8 
 
 
771 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
1052 aa  151  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
579 aa  150  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.51 
 
 
905 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
689 aa  147  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0952  hypothetical protein  31.56 
 
 
771 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 
1820 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4974  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.44 
 
 
877 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
1741 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
732 aa  140  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
559 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
778 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
389 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 
1099 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_003296  RS03712  hypothetical protein  50.36 
 
 
1178 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433519  normal  0.713314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  29.32 
 
 
541 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  29.32 
 
 
541 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  43.01 
 
 
1317 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
1877 aa  137  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  31.48 
 
 
539 aa  137  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
959 aa  137  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
1042 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  27.94 
 
 
544 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
748 aa  135  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  28.53 
 
 
531 aa  135  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
573 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  29.09 
 
 
541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  28.49 
 
 
534 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
472 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  28.57 
 
 
507 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.91 
 
 
1183 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543508  normal  0.654737 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4063  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.91 
 
 
1183 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  28.14 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  28.14 
 
 
533 aa  131  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
1039 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
516 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  45.93 
 
 
581 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
354 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  28.81 
 
 
534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0361  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  45.71 
 
 
1254 aa  128  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.31 
 
 
929 aa  127  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  47.48 
 
 
723 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  45.86 
 
 
853 aa  127  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
1672 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  26.8 
 
 
533 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  48.82 
 
 
365 aa  126  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.61 
 
 
481 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66320  hypothetical protein  36.06 
 
 
899 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  27.98 
 
 
544 aa  126  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  32.66 
 
 
354 aa  125  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.21 
 
 
888 aa  125  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.86 
 
 
1021 aa  125  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 
769 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0285  putative PAS/PAC sensor protein  43.51 
 
 
593 aa  124  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0474  sensory box/GGDEF family protein  43.57 
 
 
792 aa  123  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
574 aa  123  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  37.72 
 
 
557 aa  123  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 
773 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.6 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  30.29 
 
 
366 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
1138 aa  121  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5754  hypothetical protein  35.58 
 
 
899 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  29.34 
 
 
360 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
366 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  27.75 
 
 
534 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 
578 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0188  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.7 
 
 
578 aa  120  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
991 aa  120  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
594 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  46.96 
 
 
760 aa  120  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.71 
 
 
890 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  32.24 
 
 
345 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  49.6 
 
 
743 aa  118  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366607  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
334 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0573  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.32 
 
 
907 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102965 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 
773 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  37.1 
 
 
265 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
366 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1367  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.88 
 
 
905 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0722784  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1716  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.6 
 
 
1238 aa  116  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2346  hypothetical protein  30.77 
 
 
364 aa  116  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.35 
 
 
1017 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 
884 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40751  predicted protein  35.33 
 
 
734 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00189379 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35077  predicted protein  48.18 
 
 
110 aa  114  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0655449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>