More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3129 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  48.83 
 
 
647 aa  650    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  71.09 
 
 
641 aa  958    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  73.32 
 
 
641 aa  987    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  52.54 
 
 
637 aa  705    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  53.89 
 
 
639 aa  714    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  54.66 
 
 
630 aa  725    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  51.96 
 
 
636 aa  699    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  54.57 
 
 
630 aa  718    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  54.59 
 
 
629 aa  718    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  70.03 
 
 
644 aa  952    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  53.14 
 
 
636 aa  716    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
634 aa  1283    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  69.88 
 
 
644 aa  953    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  64.69 
 
 
640 aa  849    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  53.93 
 
 
635 aa  724    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  47 
 
 
635 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  46.85 
 
 
635 aa  615  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  47 
 
 
635 aa  618  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  45.9 
 
 
635 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  46.53 
 
 
635 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  43.32 
 
 
642 aa  526  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  42.22 
 
 
635 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 
639 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  38.77 
 
 
646 aa  488  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  38.66 
 
 
636 aa  481  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  37.92 
 
 
640 aa  427  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
634 aa  424  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  37.54 
 
 
634 aa  420  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  36.93 
 
 
635 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 
426 aa  231  4e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.17 
 
 
543 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.83 
 
 
541 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
422 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 
422 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
422 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 
421 aa  210  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 
468 aa  207  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  31.22 
 
 
469 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.65 
 
 
540 aa  206  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.32 
 
 
536 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 
570 aa  204  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 
468 aa  200  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  28.78 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 
463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 
522 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5620  beta-lactamase domain protein  31.41 
 
 
473 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 
547 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  27.52 
 
 
467 aa  194  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
525 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
821 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 
478 aa  191  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 
489 aa  191  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.72 
 
 
467 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.03 
 
 
466 aa  190  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  27.97 
 
 
535 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 
451 aa  190  8e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
478 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.98 
 
 
460 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 
454 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  30.06 
 
 
468 aa  188  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 
454 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  31.12 
 
 
480 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.07 
 
 
480 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 
460 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.07 
 
 
480 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 
462 aa  186  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  31.34 
 
 
455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.22 
 
 
466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 
465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 
515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.07 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.7 
 
 
452 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
464 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  29.43 
 
 
476 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  30.62 
 
 
454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  32.25 
 
 
455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 
535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.19 
 
 
410 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  30.68 
 
 
480 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.68 
 
 
480 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 
531 aa  183  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.7 
 
 
481 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.6 
 
 
525 aa  183  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
470 aa  183  9.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
452 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  32.15 
 
 
476 aa  183  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 
461 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 
544 aa  182  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.65 
 
 
465 aa  182  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  32.17 
 
 
484 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  30.24 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 
453 aa  181  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  31.76 
 
 
468 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
460 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 
421 aa  180  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 
536 aa  180  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  32.76 
 
 
455 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>