More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0023 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 408 aa  835    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  65.1 
 
 		 405 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  61.19 
 
 		 407 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  52.23 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  51.12 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  48.86 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  25.32 
 
 		 561 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  22.75 
 
 		 800 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0527  putative sensor with HAMP domain protein  25.25 
 
 		 313 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  26.25 
 
 		 302 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  25.41 
 
 		 302 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.89 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  25.88 
 
 		 534 aa  86.3  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  26.78 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  24.83 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 546 aa  83.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 827 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  24.25 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  25 
 
 		 560 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4236  sensor protein  28.42 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.76 
 
 		 856 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  27.2 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 862 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  26.21 
 
 		 715 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  25.26 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4067  sensor protein  25.94 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000038366 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  25.5 
 
 		 572 aa  73.6  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  29.38 
 
 		 835 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3665  putative sensor with HAMP domain  23.78 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3116  histidine kinase  23.24 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24 
 
 		 1064 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  30.43 
 
 		 187 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 604 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.5 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0300  putative sensor with HAMP domain  26.94 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  25.44 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 720 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  21.94 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.37 
 
 		 656 aa  63.9  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.574957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 736 aa  63.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0276  putative sensor with HAMP domain  21.31 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.529907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0276  putative sensor with HAMP domain protein  21.31 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  27.93 
 
 		 183 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  26.9 
 
 		 197 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  26.36 
 
 		 576 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.45 
 
 		 655 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.19 
 
 		 561 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  24.27 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  30.83 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0220  diguanylate cyclase  27.95 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.454807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  28.66 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 812 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  28.57 
 
 		 801 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  28.14 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 632 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  28.95 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.62 
 
 		 564 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  19.19 
 
 		 858 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 1271 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  20.56 
 
 		 600 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.04 
 
 		 603 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 678 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.81 
 
 		 897 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0935  putative sensor with HAMP domain  24.31 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0423027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 829 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  33.96 
 
 		 829 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  27.22 
 
 		 1119 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  25.29 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.6 
 
 		 874 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1384 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.78 
 
 		 603 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  33.67 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 		 1184 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  33.02 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  29.09 
 
 		 186 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2921  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 589 aa  57  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0105  hypothetical protein  19.38 
 
 		 299 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3011  CheA signal transduction histidine kinases (STHK)  32.14 
 
 		 796 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  40.54 
 
 		 762 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.15 
 
 		 700 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  25.19 
 
 		 571 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 591 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 		 1362 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.55 
 
 		 619 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 590 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.29 
 
 		 1131 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  24.44 
 
 		 571 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 571 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3590  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 796 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  29.01 
 
 		 200 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 555 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 591 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 		 881 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  25.45 
 
 		 613 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  25.45 
 
 		 613 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  25.45 
 
 		 613 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>