37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03805 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  100 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  42.49 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  39.18 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  41.92 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  39.26 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  40.48 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3995  hypothetical protein  45.58 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.420814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  37.7 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  38.55 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2376  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2310  cytochrome c family protein  40.14 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3151  hypothetical protein  38.06 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  36.81 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  38.51 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0806  hypothetical protein  33.67 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3727  hypothetical protein  33.98 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  38.95 
 
 		 193 aa  89.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  30.3 
 
 		 185 aa  85.5  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  38.71 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  32.12 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0245  hypothetical protein  26.8 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  29.01 
 
 		 408 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 399 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 1271 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  28.79 
 
 		 399 aa  51.6  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.91 
 
 		 720 aa  51.2  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  30.7 
 
 		 407 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  27.91 
 
 		 561 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  27.69 
 
 		 400 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.91 
 
 		 422 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 546 aa  45.1  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  26.79 
 
 		 405 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  27.59 
 
 		 582 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 1184 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 		 1184 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>