37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4079 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  43.86 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  47.65 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  40.54 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3151  hypothetical protein  38.67 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  38.8 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0245  hypothetical protein  36.88 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  38.36 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  37.84 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2376  cytochrome c family protein  34.68 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  37.67 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2310  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  35.37 
 
 		 202 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  36.47 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  38.51 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0806  hypothetical protein  38.1 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3995  hypothetical protein  38.82 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.420814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3727  hypothetical protein  36.49 
 
 		 203 aa  91.3  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  34.67 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  36.99 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  35.81 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  35.11 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  36.89 
 
 		 405 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  29.91 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  29.06 
 
 		 399 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1184 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  27.43 
 
 		 400 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  31.4 
 
 		 408 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 897 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  29.31 
 
 		 562 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.46 
 
 		 856 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  29.06 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 1184 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 632 aa  41.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  27.97 
 
 		 432 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  29.06 
 
 		 582 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>