57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01960 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  45.36 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  41.86 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  47.47 
 
 		 186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2376  cytochrome c family protein  45.18 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  41.54 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  42.04 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  40.91 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  39.38 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3151  hypothetical protein  43.51 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3995  hypothetical protein  49.65 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.420814  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0806  hypothetical protein  38.62 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  37.7 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  40.74 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2310  cytochrome c family protein  36.17 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3727  hypothetical protein  44.3 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  38.55 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  31.08 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  34.01 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  32.1 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0245  hypothetical protein  30.63 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  34.82 
 
 		 407 aa  61.6  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  31.43 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 546 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  31.19 
 
 		 405 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 400 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  33.01 
 
 		 715 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3610  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.39 
 
 		 583 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  27.68 
 
 		 399 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 573 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 399 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  28.46 
 
 		 408 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 893 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  34.34 
 
 		 582 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 		 1271 aa  48.5  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  28.35 
 
 		 422 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  33.64 
 
 		 560 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  30.33 
 
 		 561 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.29 
 
 		 655 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  30 
 
 		 562 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  28.43 
 
 		 498 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.7 
 
 		 856 aa  45.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.69 
 
 		 597 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 		 1184 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 1184 aa  45.1  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  26.49 
 
 		 572 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 897 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0220  diguanylate cyclase  25.64 
 
 		 539 aa  43.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.454807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 914 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  28.85 
 
 		 432 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  28.85 
 
 		 432 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.22 
 
 		 720 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 524 aa  41.6  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 632 aa  41.6  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 632 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.12 
 
 		 700 aa  41.2  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>