46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3429 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  49.09 
 
 		 186 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  44.21 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  46.63 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  45.56 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2376  cytochrome c family protein  43.2 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  42.69 
 
 		 214 aa  140  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  45.36 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3151  hypothetical protein  44.52 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0806  hypothetical protein  44.17 
 
 		 200 aa  131  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3995  hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.420814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2310  cytochrome c family protein  41.62 
 
 		 192 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  41.67 
 
 		 194 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  38.74 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  40.8 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  40.45 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  38.82 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  38.46 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  38.51 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3727  hypothetical protein  37.7 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  33.51 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0245  hypothetical protein  29.47 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  32.74 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  29.34 
 
 		 422 aa  64.7  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  28.79 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 897 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  28.42 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 		 408 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  29.63 
 
 		 400 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  26.83 
 
 		 562 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 		 399 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  27.2 
 
 		 399 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  33.01 
 
 		 432 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  26.67 
 
 		 572 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  30.77 
 
 		 715 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 		 1131 aa  45.1  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 432 aa  44.7  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  33.77 
 
 		 914 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 546 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  29.01 
 
 		 629 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  31.86 
 
 		 498 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  37.04 
 
 		 560 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  30.77 
 
 		 582 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 		 1184 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  24.75 
 
 		 534 aa  41.6  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.31 
 
 		 982 aa  41.6  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>