42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0806 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0806  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  41.52 
 
 		 200 aa  151  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  48.75 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  39.2 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  39.89 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2376  cytochrome c family protein  40.46 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3151  hypothetical protein  41.56 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  44.17 
 
 		 195 aa  131  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2310  cytochrome c family protein  43.2 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  39.27 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  39.64 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  38.62 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  41.88 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3995  hypothetical protein  42.36 
 
 		 187 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.420814  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  38.38 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3727  hypothetical protein  38.41 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  33.67 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  33.33 
 
 		 187 aa  98.6  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  38.1 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  36.72 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  36.73 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0245  hypothetical protein  26.16 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 807 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  33.09 
 
 		 407 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 632 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  26.13 
 
 		 422 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 432 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 632 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  32.74 
 
 		 498 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 		 1184 aa  48.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.48 
 
 		 982 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 432 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  22.66 
 
 		 562 aa  45.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  28.19 
 
 		 582 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  30.84 
 
 		 600 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1131 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  29.84 
 
 		 405 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  24.8 
 
 		 408 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  27.48 
 
 		 572 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 		 914 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  27.04 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 1271 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>