50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1290 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  53.66 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  42.61 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  46.63 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  41.25 
 
 		 193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  41.25 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2376  cytochrome c family protein  44.74 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  43.21 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  45.12 
 
 		 194 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0806  hypothetical protein  39.2 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3995  hypothetical protein  44.52 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.420814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3151  hypothetical protein  42.95 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  39.18 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2310  cytochrome c family protein  42.95 
 
 		 192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  41.54 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  35.5 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  31.58 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3727  hypothetical protein  38.14 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  35.76 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  37.65 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  38.81 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  27.45 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  26.8 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  27.27 
 
 		 405 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  25.29 
 
 		 408 aa  58.2  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  27.42 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  29.27 
 
 		 422 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 1271 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  27.38 
 
 		 572 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  27.56 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0220  diguanylate cyclase  31.3 
 
 		 539 aa  48.5  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.454807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 1184 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  32.35 
 
 		 629 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.43 
 
 		 655 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  30.08 
 
 		 498 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  26.12 
 
 		 400 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.42 
 
 		 700 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  30.65 
 
 		 432 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  27.69 
 
 		 582 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  29.6 
 
 		 432 aa  44.7  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  30.1 
 
 		 715 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.61 
 
 		 700 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 546 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 807 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.11 
 
 		 597 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 632 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  27.88 
 
 		 524 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.93 
 
 		 856 aa  42  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.47 
 
 		 720 aa  42  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>