49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0264 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  34.4 
 
 		 405 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3727  hypothetical protein  38.98 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3995  hypothetical protein  37.72 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.420814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  35.66 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  29.2 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  34.82 
 
 		 400 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  26.71 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2310  cytochrome c family protein  33.61 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  27.93 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  26.67 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  25.81 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2376  cytochrome c family protein  33.03 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  33.04 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  28.42 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  26.57 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  29.41 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  28.29 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  29.03 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3151  hypothetical protein  30.26 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.27 
 
 		 856 aa  52  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1064 aa  52  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 803 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.79 
 
 		 656 aa  50.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.574957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  28.81 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  26.79 
 
 		 582 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 546 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  27.56 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  27.5 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0245  hypothetical protein  31.25 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 		 862 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  28.66 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 946 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  25.96 
 
 		 835 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  25.2 
 
 		 561 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  29.69 
 
 		 560 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  28.1 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 872 aa  44.3  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 700 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 1271 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31 
 
 		 422 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 		 858 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1361  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 912 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 812 aa  42  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0806  hypothetical protein  27.04 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  23.16 
 
 		 801 aa  40.8  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 810 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>