63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1881 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  45.6 
 
 		 200 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3151  hypothetical protein  47.4 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  44.21 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2376  cytochrome c family protein  47.77 
 
 		 193 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  41.25 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2310  cytochrome c family protein  40.41 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  42.94 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  38.61 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0806  hypothetical protein  39.89 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3995  hypothetical protein  46.53 
 
 		 187 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.420814  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  41.29 
 
 		 194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  42.14 
 
 		 214 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  39.38 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  39.26 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  36.7 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  39.44 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  41.41 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3727  hypothetical protein  35.19 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0245  hypothetical protein  30.37 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  30.65 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  31.06 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  28.69 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  27.87 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  24.57 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.96 
 
 		 856 aa  59.7  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 603 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  33.05 
 
 		 524 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.77 
 
 		 422 aa  55.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 632 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 432 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 		 700 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1271 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  22.99 
 
 		 407 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  30.28 
 
 		 560 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 807 aa  52.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 432 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  26.4 
 
 		 561 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.93 
 
 		 700 aa  52  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  27.7 
 
 		 582 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  26.83 
 
 		 400 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 632 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 546 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 897 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  27.5 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  27.05 
 
 		 408 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  27.18 
 
 		 562 aa  48.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 		 481 aa  47.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 		 720 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  29.32 
 
 		 572 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  29.91 
 
 		 459 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  27.59 
 
 		 715 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  32.35 
 
 		 498 aa  44.7  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.45 
 
 		 614 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.73 
 
 		 1184 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3765  hypothetical protein  29.29 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3610  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.17 
 
 		 583 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 		 573 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 556 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 		 561 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182871  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.64 
 
 		 603 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  24.14 
 
 		 982 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 		 1064 aa  41.2  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>