29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3765 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3765  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2806  hypothetical protein  50.24 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  34.64 
 
 		 561 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 546 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  34.64 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  33.12 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  34.87 
 
 		 582 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.67 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 556 aa  70.1  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  33.86 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 603 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.73 
 
 		 561 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182871  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 614 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1184 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 597 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.09 
 
 		 603 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 		 700 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24 
 
 		 893 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  28.57 
 
 		 405 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 		 399 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  35.87 
 
 		 400 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 		 399 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 		 700 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  27.83 
 
 		 600 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 632 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  29.29 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 632 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  25.66 
 
 		 422 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>