45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0918 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  45.93 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2376  cytochrome c family protein  43.64 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  40.11 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  50 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  35.5 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  35.54 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  38.74 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3727  hypothetical protein  44.59 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  36.7 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3151  hypothetical protein  41.84 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3995  hypothetical protein  40.97 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.420814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  40.49 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  38.71 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0806  hypothetical protein  38.38 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  37.06 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0245  hypothetical protein  36.61 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  35.68 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2310  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  30.3 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  26.88 
 
 		 407 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  28.26 
 
 		 405 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  31.39 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  32.77 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.13 
 
 		 422 aa  62.4  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  30.83 
 
 		 408 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  29.03 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  31.62 
 
 		 715 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 1271 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  30.7 
 
 		 524 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  28.23 
 
 		 582 aa  44.7  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  32.48 
 
 		 498 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  29.73 
 
 		 432 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.86 
 
 		 700 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  27.59 
 
 		 572 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  27.87 
 
 		 562 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 897 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  26.52 
 
 		 422 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3610  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.58 
 
 		 583 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.6 
 
 		 1184 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 		 700 aa  41.2  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  28.83 
 
 		 432 aa  41.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>