50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0603 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3995  hypothetical protein  61.69 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.420814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  46.67 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  45.12 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  41.29 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2376  cytochrome c family protein  43.64 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  40.82 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  36.13 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  38.66 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2310  cytochrome c family protein  40.1 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  36.25 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3151  hypothetical protein  40.24 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0806  hypothetical protein  40.94 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  38.71 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  40.74 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  36.65 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  35.53 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  35.67 
 
 		 187 aa  91.7  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3727  hypothetical protein  35.14 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  36.48 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  37.12 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  33.01 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  31.86 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0245  hypothetical protein  26.2 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  33.02 
 
 		 408 aa  57.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  30.1 
 
 		 399 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.19 
 
 		 655 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  29.25 
 
 		 399 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 1271 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  35.19 
 
 		 560 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  30.84 
 
 		 400 aa  48.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  28.57 
 
 		 561 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  33.96 
 
 		 405 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  25.58 
 
 		 422 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1184 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 		 897 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  26.09 
 
 		 629 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  29.51 
 
 		 498 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  27 
 
 		 432 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 893 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 524 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  30.94 
 
 		 572 aa  44.7  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 		 603 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  27.64 
 
 		 562 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.26 
 
 		 856 aa  43.5  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  25.93 
 
 		 715 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  26 
 
 		 432 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 807 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 632 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 556 aa  42  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>