76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0137 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  31.58 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  36.25 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  36.02 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  36.18 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2310  cytochrome c family protein  36.94 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  39.44 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3995  hypothetical protein  38.56 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.420814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  33.51 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2376  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  40.27 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3151  hypothetical protein  34.84 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  38.46 
 
 		 195 aa  104  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  32.2 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  31.75 
 
 		 214 aa  95.9  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3727  hypothetical protein  29.38 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0806  hypothetical protein  36.73 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03805  cytochrome c family protein, putative  30 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  33.56 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  31.08 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  30.56 
 
 		 399 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  33.07 
 
 		 561 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0245  hypothetical protein  24.68 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.17 
 
 		 856 aa  68.9  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  28.38 
 
 		 405 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 		 603 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  26.71 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  25.13 
 
 		 582 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  26.9 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  32.84 
 
 		 407 aa  61.6  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  26.4 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  32.74 
 
 		 560 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  24.66 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 556 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 1271 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 		 897 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.13 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  29.13 
 
 		 715 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  23.12 
 
 		 801 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 		 700 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 1064 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 		 481 aa  51.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 524 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  26.57 
 
 		 432 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  26.92 
 
 		 562 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  31.4 
 
 		 534 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 946 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  27.68 
 
 		 432 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 		 614 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 		 914 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 573 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 700 aa  48.5  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 603 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 807 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 872 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.73 
 
 		 561 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182871  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  30.63 
 
 		 459 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  28.67 
 
 		 982 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.1 
 
 		 656 aa  46.2  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.574957  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0220  diguanylate cyclase  31.3 
 
 		 539 aa  46.2  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.454807  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.78 
 
 		 597 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  29.82 
 
 		 422 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 862 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3610  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.77 
 
 		 583 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 632 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 632 aa  45.1  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  26.89 
 
 		 629 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 893 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 		 1184 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3116  histidine kinase  27.93 
 
 		 325 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 		 1131 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  28.57 
 
 		 498 aa  41.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  27.86 
 
 		 600 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>