More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1548 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 929 aa  1880    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  43.06 
 
 		 850 aa  492  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  45.93 
 
 		 1135 aa  471  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.64 
 
 		 816 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 1202 aa  445  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.91 
 
 		 916 aa  438  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  42.22 
 
 		 852 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 		 1069 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 		 977 aa  428  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 1326 aa  426  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 		 1245 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 		 833 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  38.23 
 
 		 1574 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 		 1369 aa  422  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 818 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 		 1040 aa  418  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 925 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 		 950 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  40.79 
 
 		 1177 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 		 818 aa  416  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  37.97 
 
 		 1683 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1550 aa  412  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 1340 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.71 
 
 		 1442 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  41.42 
 
 		 1763 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.03 
 
 		 1397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  39.88 
 
 		 1765 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  40.33 
 
 		 923 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 		 1331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 1768 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 1310 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 1820 aa  406  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.98 
 
 		 1363 aa  406  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 1118 aa  406  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1245 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  38.46 
 
 		 2035 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.57 
 
 		 812 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 936 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.13 
 
 		 1398 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 		 835 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 		 876 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 		 1267 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 		 946 aa  399  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  45.52 
 
 		 847 aa  399  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 1765 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 		 1771 aa  399  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.91 
 
 		 1014 aa  399  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 1033 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 		 1548 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1611 aa  399  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.87 
 
 		 1266 aa  399  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1767 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 		 758 aa  399  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 		 1009 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  41.08 
 
 		 1030 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 		 1767 aa  396  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 1767 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 993 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 1782 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 921 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.91 
 
 		 2213 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 1165 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 		 1480 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 		 2654 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 1582 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.32 
 
 		 1468 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 		 1622 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 		 1284 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1305 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 1786 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 1792 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 1784 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.52 
 
 		 1499 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 778 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  44.51 
 
 		 977 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1255 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 1240 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 		 1128 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 		 801 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  39.74 
 
 		 1439 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 1016 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 		 920 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1130 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.55 
 
 		 1433 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.8 
 
 		 1333 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  37.01 
 
 		 932 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 1021 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1384 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  42.01 
 
 		 1346 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  35.81 
 
 		 1179 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 		 705 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.29 
 
 		 932 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 1005 aa  372  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 985 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 1203 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 		 957 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  40.35 
 
 		 750 aa  372  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 		 1788 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1166 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.61 
 
 		 929 aa  369  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>