More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2600 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  60.27 
 
 
226 aa  295  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
230 aa  290  9e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  58.45 
 
 
225 aa  275  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  58.45 
 
 
225 aa  275  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  54.79 
 
 
229 aa  270  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  55.25 
 
 
238 aa  267  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  55.96 
 
 
219 aa  266  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  56.82 
 
 
241 aa  260  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  55.66 
 
 
235 aa  259  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  54.75 
 
 
235 aa  254  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  52.27 
 
 
237 aa  251  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  53.18 
 
 
240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  54.34 
 
 
234 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  49.08 
 
 
235 aa  245  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  50 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 
244 aa  238  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  48.4 
 
 
236 aa  237  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
246 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  55.96 
 
 
233 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 
223 aa  235  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  48.61 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  51.11 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  51.14 
 
 
653 aa  231  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  50.44 
 
 
226 aa  231  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  50.44 
 
 
226 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 
240 aa  229  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  47.79 
 
 
241 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.44 
 
 
226 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  50.92 
 
 
228 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 
226 aa  228  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  51.14 
 
 
225 aa  229  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  48.86 
 
 
230 aa  228  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.77 
 
 
230 aa  228  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 
226 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50.88 
 
 
226 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 
226 aa  228  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 
226 aa  228  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50.88 
 
 
226 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 
226 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  54.34 
 
 
233 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  50.44 
 
 
226 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  50.45 
 
 
238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  51.79 
 
 
253 aa  224  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.4 
 
 
237 aa  224  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  47.95 
 
 
230 aa  224  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  47.03 
 
 
232 aa  224  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  52.51 
 
 
671 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  49.33 
 
 
241 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.4 
 
 
225 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
224 aa  221  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
224 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
224 aa  221  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  46.58 
 
 
246 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  46.58 
 
 
246 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  46.58 
 
 
246 aa  221  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  51.83 
 
 
253 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  46.19 
 
 
224 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
237 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  51.83 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  47.49 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.12 
 
 
242 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  49.09 
 
 
235 aa  219  3e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48 
 
 
252 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  45.29 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  46.58 
 
 
263 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
253 aa  218  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
246 aa  218  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  46.58 
 
 
240 aa  218  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.36 
 
 
230 aa  218  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  45.66 
 
 
247 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  45.66 
 
 
246 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  45.66 
 
 
247 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  45.66 
 
 
247 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  45.74 
 
 
224 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  49.32 
 
 
241 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  49.32 
 
 
224 aa  218  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
236 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  56 
 
 
211 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
241 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  50.23 
 
 
229 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
243 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  48.86 
 
 
661 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  48.18 
 
 
654 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  45.66 
 
 
243 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  45.21 
 
 
246 aa  215  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  45.29 
 
 
224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.47 
 
 
233 aa  214  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  48.86 
 
 
232 aa  214  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  47.22 
 
 
244 aa  214  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.66 
 
 
239 aa  214  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.12 
 
 
647 aa  214  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  48 
 
 
653 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  50 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  47.03 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>