More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1028 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  52.31 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  51.06 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  53.37 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  51.2 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  55.36 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  52.04 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  51.42 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  50.24 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  48.21 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  52.85 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  51.49 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  48.74 
 
 		 301 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  48.43 
 
 		 265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  53.4 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  62.14 
 
 		 276 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  45.89 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  46.9 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  48.87 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  53.29 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  55.62 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  53.85 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  52.07 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  46.01 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  47.94 
 
 		 336 aa  161  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  56.58 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  57.52 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  50.51 
 
 		 217 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  60.94 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  60.94 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  55.94 
 
 		 233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  53.85 
 
 		 439 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  51.2 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  53.38 
 
 		 460 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  54.4 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  45.77 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  52.56 
 
 		 262 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  46.63 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  51.18 
 
 		 484 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  53.78 
 
 		 210 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  52.14 
 
 		 120 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 191 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 		 199 aa  92  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  40.94 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  42.4 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  45.83 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  45.53 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  43.33 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  43.75 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  44.72 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  45.53 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  44.72 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.48 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  44.17 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  41.61 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  43.2 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.2 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  41.46 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  44.63 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  42.64 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  45.67 
 
 		 195 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  41.94 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.73 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  33.78 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  42.4 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  45.37 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  46.22 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  42.4 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  43.2 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  40.29 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 438 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  41.73 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 283 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  43.09 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  43.31 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  39.52 
 
 		 174 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  38.93 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  40.94 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  41.54 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  42.28 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  39.84 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  40.8 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  40.32 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  35.57 
 
 		 390 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>