More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0027 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  100 
 
 		 215 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  58.94 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  52.88 
 
 		 208 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  51.67 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  49.3 
 
 		 218 aa  168  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  53.62 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  52.63 
 
 		 244 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  54.82 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  46.57 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  48.78 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  47.09 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  46.38 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  55.05 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  49.02 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  47.22 
 
 		 705 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  44.71 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  54.5 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  53.27 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  43 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  47.29 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  46.05 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  53.61 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  48.54 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 901 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  51.69 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45.37 
 
 		 703 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  46.12 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.74 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  49.47 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  48.34 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  47.83 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  45.96 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  41.83 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.6 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  42.16 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.43 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  47.87 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 233 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  40.74 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  46.95 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  47.17 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  40.17 
 
 		 234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  47.39 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  47.57 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  39.35 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.66 
 
 		 686 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  50.82 
 
 		 210 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  48.13 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 707 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 688 aa  136  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  41.04 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 671 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  43.54 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  44.09 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  42.25 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.16 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  46.24 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.26 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  41.9 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  36.89 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  36.89 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  45.02 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  41.55 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  45.58 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  46.5 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  46.77 
 
 		 688 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  41.04 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>