54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3450 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  100 
 
 
413 aa  828  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  46.6 
 
 
548 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  48.61 
 
 
597 aa  322  9e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  43.5 
 
 
568 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  38.88 
 
 
407 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  36.26 
 
 
408 aa  245  1e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  40.26 
 
 
403 aa  242  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  39.06 
 
 
535 aa  240  3e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  36.19 
 
 
604 aa  239  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  36.36 
 
 
408 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  1.5241e-12  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  36.21 
 
 
471 aa  230  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  38.42 
 
 
541 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  38.58 
 
 
567 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  38.27 
 
 
387 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  37.57 
 
 
547 aa  222  1e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  36.6 
 
 
399 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  6.54104e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  37.34 
 
 
693 aa  214  3e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  37.32 
 
 
574 aa  201  2e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  31.92 
 
 
411 aa  201  2e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  33.25 
 
 
558 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  32.75 
 
 
727 aa  174  4e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  34.03 
 
 
850 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  30.38 
 
 
640 aa  155  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  28.64 
 
 
535 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  1.86405e-06 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  32.01 
 
 
583 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  30.9 
 
 
434 aa  149  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  34.81 
 
 
320 aa  146  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  30.13 
 
 
535 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  27.36 
 
 
658 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  26.7 
 
 
677 aa  132  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  30.69 
 
 
631 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.83 
 
 
445 aa  131  2e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  27.62 
 
 
533 aa  129  9e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  26.38 
 
 
469 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  25.5 
 
 
532 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  29.88 
 
 
441 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  31.17 
 
 
636 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  27.67 
 
 
587 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.4 
 
 
737 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  22.84 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  27.14 
 
 
450 aa  96.7  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  26.04 
 
 
589 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  22.66 
 
 
453 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  26.9 
 
 
445 aa  94  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  27.38 
 
 
442 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  22.25 
 
 
446 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.45 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  2.26064e-06  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  24.94 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  25.19 
 
 
612 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  24.94 
 
 
424 aa  80.9  4e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  26.18 
 
 
440 aa  79.7  8e-14  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  23.96 
 
 
469 aa  73.9  5e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  25.32 
 
 
701 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  22.61 
 
 
733 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>