More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0011 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0010  sensory box histidine kinase/response regulator  56.58 
 
 
727 aa  774  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
715 aa  1466  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  62.62 
 
 
726 aa  931  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  96.78 
 
 
715 aa  1404  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.99155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.39 
 
 
561 aa  343  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0144  sensory box histidine kinase  33.73 
 
 
709 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
710 aa  243  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.283964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0218  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
695 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
665 aa  224  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3734  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
665 aa  222  2e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.16 
 
 
769 aa  176  2e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  54.19 
 
 
642 aa  172  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  50.29 
 
 
642 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  25.88 
 
 
824 aa  168  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  41.71 
 
 
649 aa  167  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.76 
 
 
438 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  36.63 
 
 
420 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1917  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  37.54 
 
 
419 aa  160  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0589316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1114  putative diguanylate phosphodiesterase  53.28 
 
 
568 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2565  two component signal transduction response regulator  55.36 
 
 
703 aa  157  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1758  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  50.61 
 
 
700 aa  157  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1945  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
690 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.61188e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.44 
 
 
765 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.274696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  47.93 
 
 
637 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1825  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.15 
 
 
879 aa  151  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.21 
 
 
751 aa  151  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.69 
 
 
773 aa  151  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 
654 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.69 
 
 
773 aa  150  1e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4365  response regulator receiver protein  52.48 
 
 
340 aa  149  2e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 
1431 aa  148  4e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1885  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
694 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1630  sensory box histidine kinase  31.83 
 
 
710 aa  144  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00580838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.48 
 
 
431 aa  144  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
694 aa  143  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5218  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.86 
 
 
580 aa  142  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0126538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1144  signal transduction protein  46.71 
 
 
571 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0476  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.29 
 
 
431 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2062  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
697 aa  138  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
484 aa  136  2e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
670 aa  134  4e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
650 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
620 aa  132  2e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  44.52 
 
 
637 aa  132  2e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
641 aa  130  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  57.04 
 
 
484 aa  129  2e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
556 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
519 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
639 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
701 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
639 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
546 aa  124  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
421 aa  124  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1191  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.96 
 
 
836 aa  123  1e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.668547  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
718 aa  123  1e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
546 aa  122  2e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  29.93 
 
 
516 aa  121  4e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  34.5 
 
 
346 aa  121  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.16101e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
385 aa  121  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
639 aa  120  8e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  35.43 
 
 
516 aa  119  1e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
1711 aa  119  1e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
725 aa  120  1e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  35.43 
 
 
516 aa  119  2e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 
1977 aa  119  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 
614 aa  119  2e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.9 
 
 
482 aa  119  2e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.5 
 
 
947 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
1064 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0312  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 
556 aa  118  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  31.42 
 
 
461 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
631 aa  117  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  31.42 
 
 
461 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
1140 aa  117  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
1131 aa  117  7e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  31.42 
 
 
461 aa  117  7e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
488 aa  117  8e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
590 aa  116  1e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.48 
 
 
962 aa  116  1e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 
1002 aa  116  1e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
556 aa  116  1e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1814  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
381 aa  117  1e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  31.86 
 
 
576 aa  115  2e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
431 aa  115  2e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
695 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  32.43 
 
 
337 aa  115  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  7.36417e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
431 aa  115  4e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 
1406 aa  115  4e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  50 
 
 
394 aa  114  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
726 aa  114  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
566 aa  113  1e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
431 aa  113  1e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 
1168 aa  113  1e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
582 aa  112  2e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4668  histidine kinase  29.55 
 
 
376 aa  112  2e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158807  normal  0.364184 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
473 aa  113  2e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
599 aa  112  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 
760 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
1060 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
489 aa  112  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>