159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7241 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 649 aa  1257    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  52.94 
 
 		 559 aa  522  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  36.44 
 
 		 564 aa  293  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  36.11 
 
 		 565 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  36.12 
 
 		 560 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  35.39 
 
 		 578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 551 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  32.99 
 
 		 607 aa  201  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  32.15 
 
 		 577 aa  164  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  25.37 
 
 		 547 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  25.78 
 
 		 549 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  25.04 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  41.31 
 
 		 605 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  25.37 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  25.36 
 
 		 544 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  24.43 
 
 		 544 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  24.43 
 
 		 544 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  25.12 
 
 		 547 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.72 
 
 		 613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  25.69 
 
 		 547 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  25.47 
 
 		 869 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  22.16 
 
 		 927 aa  98.6  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  24.17 
 
 		 663 aa  90.5  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  42.47 
 
 		 593 aa  89  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  24 
 
 		 590 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  28.82 
 
 		 539 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  26.21 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  39.32 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  25.12 
 
 		 571 aa  77.4  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  38.84 
 
 		 126 aa  76.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  48 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  39.47 
 
 		 184 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  36.96 
 
 		 208 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 196 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  34.96 
 
 		 173 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  43.4 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  35.62 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  44.23 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  38.13 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 118 aa  67.4  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.19 
 
 		 208 aa  66.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  40.62 
 
 		 199 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  40.78 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.96 
 
 		 233 aa  66.6  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  33.58 
 
 		 588 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.04 
 
 		 214 aa  65.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  31.75 
 
 		 189 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  25.56 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  39 
 
 		 120 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 272 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  32.19 
 
 		 173 aa  61.6  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  34.31 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  34.31 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  24.51 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  38.98 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  36.7 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 		 172 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  34.25 
 
 		 697 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  29.84 
 
 		 124 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  34.34 
 
 		 146 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  27.09 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  38.26 
 
 		 124 aa  59.7  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  33.64 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  37.82 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  45.63 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  29.22 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  35.9 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  34.11 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  35 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  33.88 
 
 		 210 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  34.38 
 
 		 126 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  38.4 
 
 		 284 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  33 
 
 		 144 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  34.38 
 
 		 129 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  36.21 
 
 		 174 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  34.38 
 
 		 129 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  34.04 
 
 		 170 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  30.95 
 
 		 130 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 126 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  34.86 
 
 		 121 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  34.04 
 
 		 223 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 174 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 174 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 226 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 127 aa  54.7  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  34.23 
 
 		 119 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1603  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 145 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.561066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  30.95 
 
 		 124 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 229 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 226 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  31.68 
 
 		 121 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  37.86 
 
 		 180 aa  53.9  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  29.59 
 
 		 126 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  33.94 
 
 		 121 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 139 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>