More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0495 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 448 aa  907    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.34 
 
 		 626 aa  289  9e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  39.31 
 
 		 639 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.87 
 
 		 728 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.25 
 
 		 695 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.09 
 
 		 602 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  41.74 
 
 		 597 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.85 
 
 		 641 aa  282  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.28 
 
 		 593 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.28 
 
 		 593 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.08 
 
 		 705 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.26 
 
 		 706 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.08 
 
 		 705 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1455  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.92 
 
 		 651 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 		 606 aa  280  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  41.8 
 
 		 705 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.8 
 
 		 705 aa  279  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.8 
 
 		 705 aa  279  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.8 
 
 		 705 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  38.31 
 
 		 641 aa  279  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.69 
 
 		 705 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  41.69 
 
 		 705 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.6 
 
 		 756 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3491  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.27 
 
 		 635 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.394167  normal  0.250752 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.53 
 
 		 705 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.53 
 
 		 705 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 		 707 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.71 
 
 		 729 aa  275  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.98 
 
 		 593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.96 
 
 		 697 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.32 
 
 		 591 aa  274  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 		 685 aa  274  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.74 
 
 		 708 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.33 
 
 		 729 aa  273  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.31 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  40.16 
 
 		 724 aa  270  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.95 
 
 		 737 aa  270  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.02 
 
 		 659 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.22 
 
 		 602 aa  270  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.89 
 
 		 588 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.66 
 
 		 613 aa  270  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.39 
 
 		 679 aa  270  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.57 
 
 		 793 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.54 
 
 		 615 aa  269  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.72 
 
 		 653 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.89 
 
 		 584 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.66 
 
 		 592 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.38 
 
 		 607 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.61 
 
 		 681 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.39 
 
 		 681 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.3 
 
 		 714 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.79 
 
 		 617 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 		 607 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 		 607 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 		 607 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  39.61 
 
 		 681 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.2 
 
 		 641 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.84 
 
 		 602 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 		 607 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.61 
 
 		 716 aa  268  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.89 
 
 		 646 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.84 
 
 		 698 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.85 
 
 		 646 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.52 
 
 		 608 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.56 
 
 		 594 aa  266  5e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.6 
 
 		 689 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 		 724 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  37.91 
 
 		 654 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  36.97 
 
 		 636 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.28 
 
 		 592 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.1 
 
 		 607 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.19 
 
 		 698 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 608 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.92 
 
 		 633 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.23 
 
 		 725 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.75 
 
 		 630 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.28 
 
 		 790 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.87 
 
 		 698 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  39.67 
 
 		 679 aa  264  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.1 
 
 		 607 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.13 
 
 		 736 aa  264  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.19 
 
 		 733 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.65 
 
 		 610 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.38 
 
 		 721 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.9 
 
 		 658 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  41.24 
 
 		 669 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2292  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.16 
 
 		 645 aa  263  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114874  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.62 
 
 		 592 aa  263  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.5 
 
 		 600 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.23 
 
 		 599 aa  263  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.42 
 
 		 693 aa  263  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.1 
 
 		 607 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.75 
 
 		 665 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.46 
 
 		 708 aa  263  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.78 
 
 		 731 aa  263  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.9 
 
 		 610 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.9 
 
 		 610 aa  262  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.69 
 
 		 618 aa  262  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.44 
 
 		 607 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.1 
 
 		 607 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>