84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1146 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  97.16 
 
 		 2367 aa  4611    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  97.16 
 
 		 2383 aa  4614    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  97.2 
 
 		 2358 aa  4613    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  72.38 
 
 		 2620 aa  2533    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  97.64 
 
 		 2296 aa  4492    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  49.49 
 
 		 1746 aa  1355    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  41.02 
 
 		 2933 aa  1295    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  100 
 
 		 2358 aa  4789    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  32.06 
 
 		 1418 aa  556  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  29.25 
 
 		 2933 aa  553  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  32.33 
 
 		 1417 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  33.36 
 
 		 1417 aa  544  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  32.62 
 
 		 1396 aa  546  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  29.46 
 
 		 2795 aa  540  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  30.19 
 
 		 1976 aa  523  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  45.04 
 
 		 1417 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  40.14 
 
 		 5337 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  42.29 
 
 		 4953 aa  433  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  34.31 
 
 		 1050 aa  399  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  34.31 
 
 		 1075 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  34.22 
 
 		 1075 aa  396  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  43.67 
 
 		 1084 aa  369  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  54.15 
 
 		 410 aa  317  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  39.86 
 
 		 969 aa  316  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  39.86 
 
 		 941 aa  315  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  39.8 
 
 		 934 aa  291  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  54.63 
 
 		 295 aa  285  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  54.63 
 
 		 292 aa  285  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  37.98 
 
 		 730 aa  271  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  37.74 
 
 		 730 aa  263  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  37.26 
 
 		 730 aa  264  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  37.74 
 
 		 730 aa  263  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  34.89 
 
 		 724 aa  257  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  37.02 
 
 		 730 aa  254  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  31.95 
 
 		 468 aa  192  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  30.81 
 
 		 497 aa  184  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  29.98 
 
 		 474 aa  172  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  29.98 
 
 		 509 aa  172  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  29.98 
 
 		 474 aa  171  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  29.98 
 
 		 474 aa  170  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  32.41 
 
 		 464 aa  168  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  32.41 
 
 		 476 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  32.41 
 
 		 476 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  32.41 
 
 		 464 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  29.73 
 
 		 474 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  32.41 
 
 		 464 aa  167  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  32.41 
 
 		 417 aa  166  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  32.41 
 
 		 417 aa  166  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  32.41 
 
 		 464 aa  166  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  32.13 
 
 		 464 aa  163  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  37 
 
 		 660 aa  163  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  37 
 
 		 660 aa  161  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  36.16 
 
 		 660 aa  161  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  36.16 
 
 		 660 aa  160  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  36.63 
 
 		 660 aa  160  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  30.07 
 
 		 690 aa  138  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  32.26 
 
 		 1459 aa  112  8.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  33.5 
 
 		 543 aa  97.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  26.96 
 
 		 845 aa  80.1  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  25.2 
 
 		 3209 aa  68.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  26.71 
 
 		 727 aa  64.3  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  28.99 
 
 		 614 aa  61.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  32.43 
 
 		 811 aa  60.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  27.5 
 
 		 830 aa  60.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  25.98 
 
 		 609 aa  60.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  26.19 
 
 		 4672 aa  60.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  33.69 
 
 		 633 aa  57.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  26.65 
 
 		 1209 aa  57.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  32.92 
 
 		 1005 aa  56.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  26.39 
 
 		 1224 aa  56.2  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  26.39 
 
 		 1224 aa  56.2  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  25.94 
 
 		 1209 aa  55.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  37.37 
 
 		 372 aa  54.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  28.4 
 
 		 507 aa  53.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  29.41 
 
 		 850 aa  51.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1164 aa  50.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  33.94 
 
 		 857 aa  50.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  50.1  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1937  Ig domain-containing protein  27.66 
 
 		 528 aa  49.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000246116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1504 aa  49.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0553  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 		 1002 aa  48.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253544  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  25.87 
 
 		 1224 aa  47.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  24.71 
 
 		 1237 aa  46.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4857  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1112 aa  46.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>